Op locaties waar de Steenmarter opduikt verdwijnen de kerkuilen, daar bestaat geen twijfel over. In het beste geval worden ze verjaagd, in het slechtste geval opgegeten. Tijdens het broedseizoen zijn eieren en jongen een makkelijke prooi voor steenmarters. Deze lenige klimmers hebben er totaal geen probleem mee om tegen een loodrechte stenen muur op te lopen, via de invliegopening de nestkast binnen te wippen, en al wat in de nestkast zit (ook adulte kerkuilen) te prederen. Typisch aan marters is dat ze eerst alle jongen doodbijten, en daarna één voor één wegdragen. Ook eieren worden graag gegeten en naar het marternest gebracht.
In de handel is een geurstof te koop om marters weg te houden (van kippenhokken bijvoorbeeld), doch deze flesjes zijn vrij duur. Goedkoop reukwater werkt even afdoende, helaas maar tijdelijk. Een betere en efficiënte oplossing zijn anti-marterschermen die aangebracht worden voor de invliegopening. Deze gladde kraag belet dat de marters nog grip hebben om in de opening te geraken. Op locaties waar we dergelijke schermen hebben geplaatst zijn kerkuilen terug succesvol beginnen broeden, en de steenmarters kunnen alleen nog watertandend toekijken…
Voor alle duidelijkheid, ook steenmarters zijn onvoorwaardelijk wettelijk beschermd.